Hiện nay, trong quá trình thực hiện phản ứng PCR, người ta đã phát hiện ra một số hóa chất có thể ảnh hưởng đến kết quả của phản ứng này.
21/06/2019 | Xét nghiệm PCR Lao - những vấn đề đáng lưu tâm 19/06/2019 | Xét nghiệm PCR có những ưu – nhược điểm gì? 11/01/2019 | Xét nghiệm QF-PCR trong chẩn đoán trước sinh
Ý nghĩa của chất ức chế PCR
Những chất ức chế PCR có thể ảnh hưởng đến tốc độ hoặc gây nhiễu phản ứng bằng cách gắn trực tiếp vào DNA/ RNA đích, làm mất hoạt tính enzym DNA polymerase hoặc gây mất tác dụng hoạt hóa của ion Mg2+ trong quá trình phản ứng, … việc phát hiện và loại trừ các chất ức chế phản ứng PCR có tác dụng quyết định sự thành công và chất lượng của phản ứng PCR. Vì vậy, đây là một việc làm vô cùng cần thiết đối với những người thực hiện phản ứng này.
Đến nay, nhiều chất ức chế PCR đã được phát hiện trong các mẫu máu, vải, mô động thực vật, đất, … (Bảng 1).
STT
|
Các chất ức chế PCR
|
Nguồn gốc
|
1
|
Heparin
|
Máu:
+ Nội sinh: Tế bào mastocyte
+ Ngoại sinh: Ống chứa heparin
|
2
|
Hemoglobin
|
Máu
|
3
|
Heme
|
Máu
|
4
|
Lactoferrin
|
Máu, sữa, thuốc tăng cường hệ miễn dịch, thuốc thảo dược, …
|
5
|
Immunoglobin G ( IgG)
|
Máu
|
6
|
Các polysaccharide
|
Thực vật
|
7
|
Các polysaccharide tạp
|
Phân, thực vật,…
|
8
|
Muối mật
|
Phân
|
9
|
Collagen
|
Mô
|
10
|
Melanin và Eumelanin
|
Tóc, da
|
11
|
Myoglobin
|
Mô cơ
|
12
|
Các proteinase
|
Sữa,…
|
13
|
Ion Ca2+
|
Sữa, xương
|
14
|
Ure
|
Nước tiểu
|
15
|
Acid humic (gồm quinone, phenol, catechol and sugar).
|
Phân, thực vật,…
|
16
|
Thuốc nhuộm chàm (indigo)
|
Vải bông
|
17
|
Các thành phần và hóa chất khi xử lý mẫu và tinh sạch DNA/ RNA
|
Hoá chất
|
Có thể phát hiện gì thông qua chất ức chế PCR
Có thể phát hiện các chất ức chế PCR bằng cách sử dụng các chứng nội tại internal positive control (IPC) được cung cấp kèm theo bộ Kit của nhà sản xuất. Các số liệu thu được của phản ứng real-time PCR cũng có thể được sử dụng để phát hiện các chất ức chế bằng cách phân tích hiệu quả khuếch đại của mẫu.
Việc phát hiện và khắc phục ảnh hưởng của các chất ức chế phản ứng PCR cho phép các phòng thí nghiệm sinh học phân tử lựa chọn tốt các mẫu hơn, thu được tỷ lệ khuếch đại thành công cao hơn và hiệu quả của phòng thí nghiệm được cải thiện hơn.